Świątynię zaprojektował uznany wielkopolski architekt Stanisław Cybichowski. Jest on również autorem projektów gruntownego remontu kilku innych bydgoskich kościołów m.in: Katedry,  Klarysek i Pobernardyńskiego. Budowa kościoła na Czyżkówku rozpoczęła się w 1936 roku. W roku 1939 zaczęto wykonywać strop i wiązania dachowe, ale wojna przerwała prace. W czasie okupacji w gmachu funkcjonował magazyn narzędzi budowlanych. Działania wojenne spowodowały uszkodzenia kościoła i wieży. Budowę konstrukcji ukończono w latach 40. XX wieku. Jednak prace wykończeniowe oraz upiększanie wnętrza kontynuowano w kolejnych dekadach.

Kościół jest trójnawowy, z półkoliście zamkniętym prezbiterium od północy. Elementem dominującym jest wysoka kwadratowa wieża, przykryta dachem namiotowym. W ścianach bocznych znajdują się liczne witraże. To bardzo dobry przykład architektury sakralnej okresu międzywojennego.
Aktualne prace obejmują remont dachu wieży, elewacji wieży i remont elewacji frontu kościoła. Wyeksponowany ma być nadal ślad po wojennych uszkodzeniach wieży. Prace są prowadzone z wykorzystaniem miejskiej dotacji na zabytki. Szacowany koszt tego etapu prac to około 650 tysięcy złotych. Miejska dotacja to 40 tysięcy.

Warto wiedzieć:

W tym roku miejskie dotacje na prace konserwatorskie zabezpieczyliśmy dla właścicieli 17 nieruchomości. Koszt prac konserwatorskich w wiekowych budynkach szacowany jest na poziomie ponad 4,3 mln zł. Bydgoszcz znajduje się w gronie miast, które przeznaczają największą pulę środków (1,3 mln zł)  na wsparcie właścicieli zabytkowych obiektów.